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参照世界卫生组织（WHO）2024年报告标准（仅授权用于人类或最高优先级关键抗生素），好作团队共鉴定出270种重要ARG亚型，好作涉及七类抗生素，其中高频基因如tet(X)、cfr(C)、和qnrS1等在样本库中检出率超过50%，并表现出高丰度，可能会影响多种关键抗生素的疗效。复旦大学公共卫生学院粟硕教授为论文通讯作者，风建在读博士研究生石宇旗等为论文共同第一作者。

设持这为深入理解病原菌生态学和精准评估公共卫生风险提供了坚实的科学依据。所谓跨物种传播，久战通常是指微生物从一种宿主物种传播至另一宿主物种，久战并在新宿主中适应或持续存在的过程，这一现象对于理解微生物的病原生态学及其公共卫生意义至关重要。这些宿主体内，基调打特别是消化道中，存在着高度复杂且庞大的微生物群落，包括细菌、病毒、真菌等。

未来，好作这一基于多学科前沿技术交叉的强大框架可应用于探索人类对微生物的认知边界和深度，好作系统监测新发病原体、预测重要耐药性扩散趋势，为制定精准、高效的公共卫生防控策略提供核心技术支撑。风建原文链接：https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.08.016制图：实习编辑：沈家怡责任编辑：李斯嘉。

设持物种及功能注释精度不足阻碍了明确ARGs与可移动遗传元件（MGEs）的关联。

久战本研究得到了上海市优秀学术带头人项目和教育部U40项目等资助。团队利用高分辨率基因组比对与菌株分辨技术，基调打首次系统揭示了哺乳动物微生物组中广泛的跨地理区域、基调打宿主分类及生活方式界限的菌株共享现象，涵盖已知病原菌及非病原菌。

构建重要耐药基因跨宿主共享全景网络，好作揭示潜在公共卫生风险图2：好作哺乳动物携带的重要ARG的多样性和可转移性基于ARG与MGE高精度注释框架，在哺乳动物微生物组中鉴定出521种潜在ARGs，涵盖13类抗生素，其中氨基糖苷类、大环内酯-林可酰胺-链霉素类（MLS）、四环素类及β-内酰胺类为主要耐药类别。全球首次绘制哺乳动物高分辨率微生物图谱图1：风建哺乳动物的高分辨率微生物组基于高分辨率微生物组解析框架，风建研究团队回收了245个病毒、25,442个细菌、13个真菌和2个寄生虫基因组，极大扩展了现有微生物参考数据库。

多层次群落结构分析显示，设持微生物群落在相同地理区域、宿主分类、及生活方式下显著相似，表明这些因素是形成与维持群落的关键驱动力。追踪病原与耐药基因，久战为精准公共卫生防控奠基本研究构建的综合多组学高分辨率微生物组解析框架及ARG与MGE高精度注释体系，久战首次实现了对哺乳动物微生物组中低丰度及新型微生物的精确鉴定，以及对病原菌株和临床重要ARGs跨宿主传播路径的高精度追踪。